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基于拉曼光谱的评估细胞分化阶段的方法和系统
本发明提供一种评估细胞分化阶段的方法。本发明方法包括:(a)提供单细胞的光谱数据集,所述光谱数据集包括多分化阶段的单细胞的拉曼光谱数据;(b)对所述光谱数据集中的拉曼光谱数据进行数据预处理,得到预处理后的光谱数据集;和(...
李虹沈碧寒潘国宇马晨
一种基于表面增强拉曼光谱和卷积神经网络的无损识别干细胞分化阶段方法
一种基于表面增强拉曼光谱和卷积神经网络的无损识别干细胞分化阶段方法,包括以下步骤:A、数据集获取;在iPSC分化过程中分别取第1、4、7、10、15天的细胞,与AuNRs与线粒体定位信号肽结合的线粒体靶向探针共孵育,利用...
钟丽云万鉴辉黄韬张潇
基于多组学探究棉花花芽分化阶段的代谢通路及基因挖掘
棉花是一种重要的作物,其纤维可以作为纺织业的主要原材料。近年来,我国人口多、人均耕地面积小的问题日益突出,解决当前国内粮棉争地这一问题的重要性不言而喻。为了解决这一问题,系统生物学技术被广泛应用。随着现代分析技术的不断进...
李文杰
关键词:棉花花芽分化
紫玉兰‘红元宝’花芽分化阶段基因定量分析的内参基因筛选被引量:3
2022年
为筛选紫玉兰‘红元宝’(Magnolia liliflora‘Hongyuanbao’)二次花芽分化阶段稳定表达的内参基因,该研究以‘红元宝’不同花芽分化时期的花芽和叶为材料,基于转录组数据,筛选出8个候选内参基因,即泛素酶基因(UBC)、肌动蛋白(ACT)、微管蛋白β链(β-TUB)、微管蛋白β-5链(β-TUB5)、微管蛋白α-3链(α-TUB3)、磷酸烯醇丙酮酸羧化酶(PEPC)、酰基载体蛋白2(ACP2)、酰基载体蛋白3(ACP3)。运用Primer Premier 5设计引物,简单克隆和熔解曲线验证引物特异性;利用qRT-PCR技术检测各个候选内参基因的表达情况,结合GeNorm、NormFinder、BestKeeper软件和RefFinder在线工具综合评估其表达稳定性,并通过目的基因TFL1的表达分析验证其可靠性。结果表明:(1)8个候选内参基因条带位置正确,熔解曲线呈单一峰,说明引物特异性良好。(2)β-TUB、β-TUB5和α-TUB3是‘红元宝’不同花芽分化时期较为稳定的内参基因,而UBC和ACT为稳定性最低的内参基因。(3)β-TUB5、α-TUB3、β-TUB及其组合的相对表达量趋于一致,而ACT和UBC并未对目的基因的表达量进行有效的标准化。因此,β-TUB、β-TUB5和α-TUB3可作为‘红元宝’二次花芽分化研究中稳定表达的内参基因。该研究结果将为木兰属植物二次成花分子调控机制研究提供依据。
章颖佳程少禹王卓为戴梦怡董彬张超张超王亚玲王亚玲
关键词:紫玉兰QRT-PCR
北美兰云杉体胚发生关键技术优化及体胚分化阶段生理机制研究
北美兰云杉(Picea pungens var.glauca)原产自北美,树形优美,针叶终年呈现美丽的蓝色,是园林中珍稀的彩叶树种,具有极高的观赏价值。近年来,北美兰云杉种苗市场需求量逐渐增大,但是北美兰云杉种子繁殖存在...
曹茜
关键词:北美兰云杉体胚发生超低温保存内源激素
在人胚胎干细胞培养和造血分化阶段采用不同干预促进造血分化效率的探索
背景:通过不同方式改变人类多能干细胞在干细胞培养阶段和向造血分化阶段的细胞状态,可以深刻改变其造血分化的进程,也是探索其相关分子调控机制的重要途径。我们试图采用外界刺激(纳米材料培养)和改变转录谱(改变信号通路和基因表达...
易丹英
关键词:P18HOXA9造血分化
文献传递
辣木愈伤组织诱导与分化阶段内源激素的动态变化被引量:1
2021年
【目的】为辣木组织培养再生体系的建立提供参考。【方法】以辣木叶片、茎段和花药为外植体,采用酶联免疫吸附法(ELISA),在其愈伤组织诱导和分化阶段的0~28 d内,每7 d取样1次,测定吲哚乙酸(IAA)、脱落酸(ABA)、玉米素(ZT)和赤霉素(GA_(3))含量,分析了4种内源激素含量及其比值的动态变化,探讨植物内源激素与辣木愈伤组织诱导分化的关系。【结果】叶片、茎段和花药最早形成细胞团分别为培养14、7和21 d时。在辣木叶片、茎段和花药愈伤组织诱导和分化阶段,IAA和ABA含量处于高水平,ZT和GA_(3)含量处于低水平。在辣木叶片、茎段和花药愈伤组织诱导阶段,IAA、ZT和GA_(3)含量总体呈下降趋势;分化阶段,IAA、ZT含量总体呈上升趋势,GA_(3)含量呈现先升、后降的变化趋势。在辣木愈伤组织诱导与分化阶段,ABA含量波动较大,说明内源ABA在辣木愈伤组织诱导与分化中发挥重要作用。就激素含量比值而言,愈伤诱导与分化阶段w(IAA)/w(GA_(3))和w(IAA)/w(ZT)的值较高且变化较明显,w(IAA)/w(ABA)、w(GA_(3))/w(ABA)、w(GA_(3))/w(ZT)和w(ZT)/w(ABA)的值较低且平稳。辣木叶片和花药愈伤组织诱导阶段,w(IAA)/w(GA_(3))和w(IAA)/w(ZT)的值总体呈下降趋势,茎段愈伤组织诱导阶段w(IAA)/w(GA_(3))和w(IAA)/w(ZT)的值总体无明显变化;辣木茎段和花药愈伤分化阶段w(IAA)/w(GA_(3))和w(IAA)/w(ZT)的值总体呈上升趋势,叶片愈伤分化阶段w(IAA)/w(GA_(3))和w(IAA)/w(ZT)的值总体无明显变化。【结论】低含量的ZT有利于辣木愈伤组织的形成,高含量GA_(3)抑制辣木愈伤组织的形成;高含量的ABA、低含量的ZT和较高的w(IAA)/w(GA_(3))、w(IAA)/w(ZT)值共同抑制了辣木愈伤组织分化完整植株。
杜建武阮明菊王韦王睿黄苏南张慧曾千春
关键词:辣木内源激素吲哚乙酸脱落酸玉米素赤霉素
基于二代测序的不同分化阶段晶状体转录组分析被引量:2
2020年
目的了解分化中晶状体的转录谱,包括mRNA、长链非编码RNA(lncRNA)和环状RNA(circRNA)。方法实验研究。提取人源性分化晶状体RNA并纯化。然后使用Illumina HiSeq 2500对16、23、25周晶状体总RNA样本进行测序,并使用生物信息学工具进行分析,筛选出最高表达和差异表达的mRNA和lncRNA;用维恩图分析3个时期晶状体的重叠基因表达情况;分析晶状体特异性基因的表达趋势,并用实时荧光定量PCR验证。结果在16、23、25周晶状体中分别获得67518311、99440160和67262320条映射序列。基因重叠表达分析显示,前1000个高表达mRNA、前300个高表达lncRNA和前100个高表达circRNA中分别有740、170、69个在16、23、25周晶状体中同时表达。晶状体特异性基因表达分析显示,晶状体蛋白(CRY)AA、CRYGA、CRYGB、CRYGC、CRYGD、CRYGEP和CRYGS基因表达随晶状体分化时间上调,缝隙连接(GJ)蛋白GJA3和GJA8基因表达随晶状体分化时间下调。结论晶状体转录组表达谱显示不同分化阶段晶状体的高表达mRNA、lncRNA和circRNA中重叠表达者占半数以上,且均高表达晶状体特异性蛋白基因,如CRY、GJ蛋白基因等。
张丽芳秦祯蔚卢冰吕丹旎李嘉永闫晨曦宋帆唐俏梅尹厚发傅秋黎
关键词:基因表达谱
色素关键基因在山羊皮肤和B16-F10细胞增殖、分化阶段的表达及相关性研究被引量:4
2019年
【目的】为探讨山羊ASIP、EDN3、PAX3、TYR、TYRP1和DCT 6个黑色素相关基因在不同肤色成年山羊皮肤组织中的表达差异和在B16-F10细胞中的表达规律。【方法】以酉州乌羊和板角山羊皮肤组织、B16-F10增殖和分化细胞为试验材料,应用qRT-PCR检测了以上6个黑色素相关基因的表达并分析了基因间的相关性。【结果】皮肤组织检测结果显示,与板角山羊相比,酉州乌羊皮肤ASIP表达极显著下调(P<0.01),PAX3、TYR、TYRP1和DCT表达显著上调(P<0.05或P<0.01)。体外实验分析结果发现,在黑色素细胞增殖阶段ASIP、EDN3、TYRP1和DCT具有相似的表达模式,而R4X3与7TR表达模式相似,表明它们在色素细胞增殖过程中发挥不同的调节作用。在黑色素细胞分化阶段,ASIP与TYR、TYRP1和DCT具有相似的表达模式,且表达量显著相关,表明他们参与了黑色素细胞的分化及黑色素合成的调控。【结论】ASIP下调与PAX3、TYR、TYRP1、DCT上调与酉州乌羊皮肤黑色素异常沉积表型有密切关系。
蒋婧任航行任航行王高富李杰付琳王高富刘良佳周鹏
关键词:酉州乌羊黑色素
春季穗分化阶段低温处理对不同小麦品种幼穗结实性及生理特性的影响被引量:29
2019年
研究低温胁迫对不同抗倒春寒能力小麦品种幼穗结实性和生理特性的影响,分析抗倒春寒能力不同的小麦品种对低温胁迫的生理响应机制,为小麦抗倒春寒研究和品种改良提供理论参考。以2个小麦品种矮抗58(抗倒春寒)和郑麦366(不抗倒春寒)为材料,采用盆栽和人工模拟倒春寒处理的方法,分析研究了小麦雌雄蕊原基分化期、药隔分化期和四分体形成期0℃低温处理下小麦的结实特性和幼穗生理指标变化。结果表明,在雌雄蕊原基分化期、药隔分化期、四分体形成期进行低温处理,随处理时间的延长,2个参试品种的穗粒数均降低,但不同处理时间和品种间穗粒数降低幅度不同。雌雄蕊原基分化期低温胁迫处理24,48,72h后,矮抗58穗粒数分别下降了6.52%,14.07%,22.37%,郑麦366穗粒数下降了37.14%,44.43%,64.71%;药隔分化期低温处理24,48,72h后,矮抗58穗粒数分别下降了3.74%,9.05%,13.71%,郑麦366穗粒数下降了27.54%,37.80%,48.55%;四分体形成期低温处理24,48,72h后,矮抗58穗粒数分别下降了2.70%,4.70%,4.73%;郑麦366分别下降了12.39%,29.67%,32.30%。随着低温处理时期的延迟,矮抗58、郑麦366的穗粒数降幅均表现下降的趋势。雌雄蕊原基分化期低温处理穗粒数下降最明显,说明雌雄蕊原基分化期对低温较敏感。矮抗58、郑麦366幼穗雌雄蕊原基分化期、药隔分化期低温处理72h内,2个参试品种幼穗的可溶性糖和可溶性蛋白质含量总体上均呈先升高后缓慢降低的趋势。矮抗58的可溶性蛋白质和可溶性糖含量及上升幅度均大于郑麦366。低温处理后,2个小麦品种幼穗超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)、过氧化氢酶(CAT)活性升高且均高于对照,但随着低温处理时间的延长稍有下降,其中矮抗58幼穗中SOD、POD、CAT活性和上升幅度均高于郑麦366,并且丙二醛(MDA)含量的增幅小于郑麦366。相关分析结果表明,低温胁迫后,�
张自阳王智煜王斌王志伟朱启迪霍云风茹振钢刘明久
关键词:小麦幼穗穗分化结实性生理特性

相关作者

阮国瑞
作品数:148被引量:324H指数:12
供职机构:北京大学人民医院
研究主题:引物 试剂盒 探针 急性髓系白血病 多发性骨髓瘤
邓海华
作品数:216被引量:908H指数:21
供职机构:中南大学
研究主题:甘蔗 斑茅 甘蔗新品种 甘蔗品种 宿根矮化病
许屏
作品数:12被引量:14H指数:2
供职机构:天津医科大学基础医学院
研究主题:荧光染色法 染色法 巨噬细胞 荧光 淋巴细胞
马大龙
作品数:398被引量:1,370H指数:22
供职机构:北京大学
研究主题:细胞因子 细胞凋亡 大肠杆菌 新细胞 白细胞介素
王绪华
作品数:4被引量:0H指数:0
供职机构:北京大学人民医院
研究主题:蛋白编码基因 白血病治疗 白血病细胞分化 白血病细胞 白血病