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基于SNP芯片的内江猪群体遗传结构分析被引量：1: 2024年; 本研究旨在分析内江猪群体的遗传结构,从而更好的保护和利用内江猪遗传资源。使用猪50K SNP芯片,对237头(24头公猪,213头母猪)内江猪进行基因组分型,分型结果经质量控制及自填充后用于后续分析。通过多种分析软件对内江猪群体的遗传结构、遗传多样性以及群体近交情况进行分析,结果发现:共有26652个SNP位点用于分析,其有效等位基因数为1.569,多态性标记比为0.533,多态性信息含量为0.272,期望杂合度为0.338,观测杂合度为0.341,最小等位基因频率为0.249。主成分分析结果表明群体内分层不明显,根据状态同源计算的群体平均遗传距离为0.252,通过聚类分析可将24头公猪划分为10个家系。在群体基因组中共检测到7031个长纯合片段,其平均长度为12.59 Mb,通过连续性纯合片段估计群体近交系数为0.008,通过SNP纯合性估计群体近交系数为-0.012。总体来说,内江猪群体遗传多样性较为丰富,群体遗传距离较远,近交程度较低,但存在一定的近交风险。本研究可为内江猪的保护和开发利用提供理论依据。; 龙熙吴平先潘红梅潘红梅巫英燕查琳邓元彬白小青; 关键词：内江猪

内江猪的遗传结构分析: 2024年; 旨在研究内江猪群体的亲缘关系和遗传结构。采用“中芯一号”芯片检测30头内江猪的单核苷酸多态性(SNP);采用GCTA软件构建G矩阵,PLINK软件构建状态同源(IBS)距离矩阵,分析内江猪群体的亲缘关系;采用Mega X软件构建群体进化树,分析内江猪群体的遗传结构。结果:共检测到57466个SNP位点,29468个SNP位点通过质量控制;内江猪试验群体具有中等程度的亲缘关系;群体进化树将内江猪公猪被分为6个血缘,血缘数量与传统系谱记录的基本相同;基于连续性纯合片段(ROH)的平均近交系数为0.243。综上,内江猪血缘较少,有一定程度的近交,可引入新血缘,提高群体遗传多样性和种群质量。; 杨雪梅陶璇顾以韧梁艳雷云峰杨跃奎曾凯王言陈晓晖龚建军吕学斌; 关键词：内江猪

内江猪与伍隍猪胴体性状、肌肉品质和气味轮廓的比较分析被引量：1: 2024年; 为探究内江猪与伍隍猪胴体、肉质和气味轮廓之间的差异,本试验选取日龄相同的内江猪与伍隍猪母猪各5头进行屠宰。屠宰前测定猪只活体重,宰后测定胴体重、瘦肉率、胴体直长、背膘厚、皮厚、眼肌面积等胴体性状;屠宰后取眼肌和腰肌,测定pH、肉色、滴水损失、剪切力、肌内脂肪等肉质性状;屠宰后取眼肌,使用电子鼻测定气味轮廓。结果表明:内江猪的胴体直长、6~7肋皮厚和眼肌面积都极显著低于伍隍猪,骨率显著低于伍隍猪;内江猪和伍隍猪都没有出现PSE肉和DFD肉,测定的全部指标都处在正常优质猪肉品质范围内,伍隍猪的眼肌肌内脂肪显著高于内江猪;电子鼻分析显示,内江猪和伍隍猪眼肌的气味轮廓存在显著差异,内江猪的18个传感器中14组数据极显著高于伍隍猪,1组数据显著高于伍隍猪,酮类、醇类、醛类等在内江猪中传感器响应值更高。由此可见,虽然内江猪与伍隍猪在地理上相近,但胴体、肉质和风味方面都存在差异,这为中国地方猪种遗传资源的保护及开发提供了理论支持。; 淡海锋张惠玲邹宇代浩东王恋琪沈林園甘麦邻朱砺; 关键词：内江猪胴体品质肉品质

内江猪优势杂交组合的选择和分析: 周程鹏

基于低深度全基因组测序分析内江猪群体结构和遗传多样性被引量：5: 2023年; 旨在更好的了解内江猪群体结构和遗传多样性,更好的保护和利用内江猪遗传资源。本研究基于低深度全基因组测序,检测了133头(12头公猪,121头母猪)内江猪的SNP,按照SNP检出率大于90%和95%获得两组SNP数据,分别编号为NJ90和NJ95。针对两组数据,通过群体分层、遗传距离、亲缘关系、家系划分等方法分析了内江猪群体结构,通过等位基因频率、有效等位基因数、多态性标记比、杂合度等指标估计了群体遗传多样性,最后利用不同方法评估了群体近交系数。结果显示:(1)NJ90共包含135760个SNPs位点,其等位基因频率为0.87,有效等位基因数为1.27,多态性标记比为0.76,观测杂合度为0.15,期望杂合度为0.21;NJ95包含32266个SNPs位点,其等位基因频率为0.79,有效等位基因数为1.44,多态性标记比为0.74,观测杂合度为0.30,期望杂合度为0.31。(2)NJ90结果显示群体平均遗传距离为0.20,平均亲缘系数为0.9%;NJ95结果显示群体平均遗传距离为0.25,平均亲缘系数为0.7%。(3)根据NJ90公猪和群体聚类以及亲缘关系,可将群体分为6个家系。(4)根据SNP纯合性评估群体近交系数,NJ90和NJ95平均近交系数分别为0.27和0.01;根据连续性纯合片段估计群体近交系数,NJ90和NJ95平均近交系数分别为6.65%和0.02%。综上所述,内江猪群体具有较为丰富的遗传多样性,群体遗传距离和亲缘关系较远,近交程度较低,根据公猪聚类和亲缘关系可以分为6个家系,具有较好的遗传资源保护和开发利用的基础。同时低深度重测序对比SNP芯片能够更大范围覆盖基因组信息,对群体遗传多样性分析和遗传结构分析更具参考价值。; 赵真坚王书杰陈栋姬祥申琦余杨崔晟頔王俊戈陈子旸唐国庆; 关键词：内江猪

内江猪精液品质分析及冷冻程序优化探索: 2023年; 【目的】围绕内江猪精液品质和冷冻精液流程优化进行研究,以更好实现对内江猪的保种和开发利用。【方法】使用同一时期采精的5头内江猪精液检测了精子的活率、活力、运动状态和生化指标(甘油三酯、过氧化氢等),分析精子活力和精浆各生化指标相关性,并根据课题组此前的研究,进行了冷冻精液流程优化。【结果】平衡12 h后内江猪精液活力指标显著下降,原地移动精子数显著上升(P<0.05)。精子活力与精浆H_(2)O_(2)和MDA含量呈负相关,而与TG含量呈正相关关系。采用温和的离心方式(2000×g,7 min)、较高的甘油浓度(终浓度8%)对冷冻精液流程优化后,精子冷冻前活率提升了10.28%,活力提升了15.75%(P<0.05)。在低温慢速(37℃,20 s)条件下,冷冻保存内江猪精液解冻后活率最高(53.18±5.68)%。【结论】根据内江猪精液特点,优化后的冷冻程序和低温慢速(37℃,20 s)的解冻程序更适合内江猪。; 陈景运甘麦邻胡晓沈林園朱砺; 关键词：内江猪精液品质冷冻精液保种

内江猪生长曲线拟合及体重预测模型构建被引量：8: 2023年; 为研究内江猪生长发育规律,本研究测定了346头内江猪的体重,并使用Logistic、Gompertz和Von Bertalanffy这3种非线性生长曲线模型对其进行生长曲线拟合,使用最佳的生长曲线模型计算相对生长量(R)和绝对生长量(G)。对114头内江猪的体重和体尺进行相关性分析,进一步构建体重预测模型。结果表明:Gompertz模型对内江猪体重具有最佳的拟合效果,该模型估计的拐点日龄为156.74 d,拐点体重为64.41 kg。通过对内江猪生长发育规律分析,发现内江猪在180日龄时生长速度达到最大,之后随日龄的增加逐渐下降,体重与体尺性状间呈正相关关系。雌性内江猪的最佳体重预测模型为:BW=20.1+0.644BH+0.304BL+0.472CC,R^(2)=0.645;雄性内江猪的最佳体重预测模型为:BW=2.7+0.884BH+0.477BL+0.260CC,R^(2)=0.777。内江猪体重拟合效果最好的模型是Gompertz模型。以上结果可为内江猪饲养管理和生长发育的相关研究提供一定的理论基础。; 陈景运甘麦邻胡晓沈林園朱砺; 关键词：内江猪

内江猪保种养殖现状及产业发展建议被引量：2: 2023年; 猪种质资源是国家战略性资源,是发展现代养猪业的前提和基础。猪粮安天下,农以种为先,“种业是农业的芯片”,2021年中央一号文件明确指出打好种业翻身仗,保护和利用好中国地方猪种质资源是打好生猪种业翻身仗的核心内容。2022年中央一号文件指出要大力推进种源等农业关键核心技术攻关。2023年中央一号文件要求深入实施种业振兴行动,要全面实施生物育种重大项目,扎实推进国家育种联合攻关和畜禽遗传改良计划。日趋单一化的猪种资源会导致猪只丧失对复杂多样生态环境的适应能力,从而成为未来养猪业生产不稳定的主要根源。; 刘贵平巫英燕查琳李清亮钟海波易霞周天予周月华; 关键词：战略性资源养殖现状生物育种猪种资源

内江猪遗传资源保护现状及建议: 2023年; 猪粮安天下,良种铸基石,种业是国家战略性、基础性核心产业。种质资源是种业的“芯片”,做好种质资源的收集、保护和利用,是推动我国种业发展的第一步,是确保农业农村高质量发展的“源头”,是保障国家粮食安全的重要保障。猪种质资源是国家战略性资源,是发展现代养猪业的关键,内江猪是我国最优良的地方猪种之一,是长期自然选择和人工培育联合作用的结果,其遗传资源是一种珍贵的生物种质资源,是生物多样性的重要组成部分,以其多个优良的遗传性状名列中国地方优良畜禽品种资源的前矛,也是多年来我国推广数量较多,覆盖地域较广的地方猪种。; 查琳易霞周天予刘煜李清亮巫英燕刘贵平周月华; 关键词：战略性资源畜禽品种资源地方猪种生物种质资源遗传资源

内江猪种质特性及遗传资源保护研究: 内江猪是西南型猪种中的代表性猪种，具有适应性强、耐粗饲、沉脂能力强等优点，但存在生长缓慢、屠宰率低、瘦肉率低等不足。尽管内江猪是我国较早开展遗传资源保护的品种，但20世纪末以来仍然受到国外商品猪种的冲击一度濒临灭绝，内江...; 张海浪; 关键词：内江猪种质特性冷冻精液遗传资源保护

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