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GnIH基因多态性与鹅产蛋和体组成性状的关联分析被引量：4: 2021年; 为研究促性腺激素抑制激素基因(GnIH)的系列特征,以及其SNP多态性位点对四川白鹅产蛋和体组成等性状的影响,克隆了GnIH基因DNA序列,并与哺乳动物和其他禽类进行生物信息学分析;该基因DNA序列比对到鹅参考基因组序列筛选SNP位点,随后采用Sanger方法直接测序PCR产物的方法,检测四川白鹅群体(208个体)中该基因序列,该序列包含3个外显子和2个内含子,CDS区长522 bp,173个氨基酸的前体蛋白GnIH氨基酸序。通过多重比对分析后,统计该基因在四川白鹅群体中SNP位点的基因型及其频率,进而与鹅产蛋和体组成等11个重要经济性状进行关联分析。获得了3735 bp的GnIH基因DNA序列,遗传进化分析显示,四川白鹅GnIH基因与绿头鸭的序列相似度最高(99%);序列比对到鹅参考基因组序列发现该基存在26个SNP位点;SNP位点基因型频率与性状关联分析结果表明:该基因11个SNP位点(g.811T>C、g.1892T>C、g.1320G>A、g.1809G>T、g.2164C>G、g.1708A>G、g.2164C>G、g.1809G>T、g.1892T>C、g.1929C>A和g.2164C>G)与初产蛋质量、体斜长、颈长、胸宽和胫围等性状显著或极显著相关(P<0.05或P<0.01),所有SNP位点而与48周产蛋数、64周产蛋数、出生质量、半潜水长、龙骨长、骨盆宽等无显著相关(P>0.05)。四川白鹅GnIH基因序列与绿头鸭亲缘关系最相近;本研究克隆的3735 bp的DNA序列中存在26个SNP位点,其中11个SNP位点可作为四川白鹅初产蛋质量、体斜长、颈长、胸宽和胫围等经济性状的潜在的分子标记之一。; 高广亮张克山张克山赵献芝陈主平赵献芝王启贵; 关键词：SNPS 产蛋性状体组成性状分子标记辅助选择

鸡FAS基因多态性与生长和体组成性状的相关分析: 为探讨鸡FAS 基因多态性对肉鸡生长和体组成性状的影响,以东北农业大学F2 资源群体为试验材料,对鸡FAS 基因7bp I/D 多态性位点利用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOFMS)方法检测个体基因型,...; 徐松松顾志刚李玉茂栾鹏原辉王宇祥张慧王守志李辉; 关键词：多态性体重

鸡FABPFABP2基因单倍型与生长和体组成性状的相关分析被引量：5: 2016年; 为探讨鸡FABP2基因多态性对肉鸡生长和体组成性状的影响,以东北农业大学F2资源群体为试验材料,对鸡FABP2基因3个多态性位点（c.601A＞T,c.1018C＞T和c.3267G＞A）利用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱（MALDI-TOF-MS）方法进行基因型分析,利用3个多态性位点基因型信息构建单倍型并分析单倍型与鸡生长和体组成性状的相关性.结果：FABP2基因3个多态性位点构建的单倍型对鸡2～12周龄体重、龙骨长和4周龄跖骨长有显著影响（P＜0.05）;对8和10周龄跖骨长、跖骨围、胸宽、腹脂率、胫骨长有一定的影响（P＜0.2）.由此推断：影响鸡体重和骨骼性状的QTL可能位于此单倍型区域内,ACG单倍型为提高体重和骨骼性状的有利单倍型.; 徐松松安荣荣陈耀峰程敏李辉王守志; 关键词：单倍型体重骨骼

京海黄鸡体组成性状的全基因组关联分析被引量：8: 2015年; 为了获得影响京海黄鸡体组成性状的SNPs标记及候选基因,为京海黄鸡的进一步遗传改良提供新的方法,本研究使用Illumina公司的鸡60KSNP芯片,对京海黄鸡13个体组成性状进行全基因组关联分析。共筛选出13个与体组成性状达到5%Bonferroni全基因组显著相关的SNPs(P<1.8E-6),130个达到5%Bonferroni全基因组潜在相关的SNPs(P<3.59E-5)。13个显著SNPs位于GRIK1、NCAPG、KCNIP4和CACNA2 D2等12个基因的附近或内部,其中6个SNPs位于4号染色体上一个1.6Mb区域(74.3~75.9Mb)。130个潜在显著的SNPs中,有25个集中分布在4号染色体上的一个7.4Mb(71.5~78.9Mb)的区域内。共构建了5 650种单倍型,其中,14个与京海黄鸡6个体组成性状显著相关,14个单倍型中,9个位于4号染色体74.3~75.9Mb区域内,该区域内包括LCORL、QDPR、KCNIP4、LDB2和FAM184B在内的多个功能基因。本研究结果表明,位于4号染色体的71.5~78.9 Mb区域以及该区域附近的GRIK1、NCAPG、KCNIP4、CACNA2 D2、LCORL、QDPR、KCNIP4、LDB2和FAM184B基因对京海黄鸡的体组成有重要影响。; 张涛樊庆灿张向前张向前王金玉张跟喜; 关键词：京海黄鸡全基因组关联分析体组成单倍型

鸡MC3R基因多态性与体重和体组成性状的相关研究被引量：2: 2015年; 研究将鸡黑素皮质素受体3(MC3R)基因作为影响鸡体重和体组成性状的候选基因,以东北农业大学肉鸡高、低脂双向选择品系第六、七、八世代为研究对象,采用PCR-SSCP和测序方法检测了MC3R基因编码区的多态性位点,并分析了MC3R基因多态性对鸡体重的影响。结果在MC3R基因编码区发现了一个C273T单碱基突变,此多态性位点对第六世代和第八世代两个群体的7周龄体重和屠体重有显著影响。结果可为后续肉鸡体重性状的分子标记辅助选择提供理论依据。; 张心扬霍明东王守志冷丽; 关键词：SNPS 标记辅助选择

A-FABP基因与肉鸡生长和体组成性状的相关分析被引量：3: 2014年; 为探讨A-FABP基因多态性对肉鸡生长和体组成性状的影响,本研究以东北农业大学建立的F_2资源群体为实验材料,对A-FABP基因的8个SNPs以及利用滑动窗口的方法构建的单倍型与鸡生长和体组成性状进行关联分析。结果表明:A-FABP基因8个SNPs以及所有单倍型均对龙骨长有极显著影响(P<0.01);SNP1-7以及所有单倍型对6周龄体重显著或极显著影响(P<0.05或P<0.01);SNP3、4、6和7以及所有单倍型对均对股骨长、小胸肌重和小胸肌率有显著或极显著的影响(P<0.05或P<0.01)。本研究结果说明,鸡A-FABP基因多态性对鸡的体重和部分体组成性状有显著或极显著影响。这些结果为深入研究A-FABP基因的功能奠定了基础。; 高广亮关天竹王海威王守志李辉王启贵; 关键词：单倍型体组成性状

BMP7基因多态性与肉鸡生长和体组成性状的关联研究被引量：6: 2013年; 为探讨鸡BMP7基因多态性对肉鸡生长和体组成性状的影响,选用东北农业大学肉鸡高、低脂双向选择品系(第6、8、10世代)、AA肉鸡随机群体为试验材料,分析了BMP7基因多态性与肉鸡生长和体组成性状的相关。结果发现在BMP7基因编码区第567bp处存在1个C→T的变异位点。关联分析结果表明,该变异位点在第8世代高脂系群体中对跖骨长有极显著影响(P<0.01);在第10世代高脂系群体中对腺胃重、腺胃比率、胸宽、大胸肌重有显著影响(P<0.05),对股骨重有极显著影响(P<0.01)。因此,BMP7基因可能是影响肉鸡骨骼性状的重要基因之一。; 程博涵冷丽王守志陈曦李辉; 关键词：肉鸡单核苷酸多态性体组成性状

DNAJB6等五个基因的多态性与鸡生长和体组成性状的关联研究被引量：1: 2013年; 根据鸡腹脂性状的全基因组关联分析研究筛选出五个与鸡腹脂重和腹脂率极显著相关的突变位点:rs16426347、GGaluGA262866、rs16425708、rs14087994和rs14135995,这些位点分别位于SRD5A3,SGCZ,DLC1,GALNT9和DNAJB6基因上。针对这些位点,以东北农业大学高、低脂系肉鸡第14世代群体和AA随机群体为试验材料,进行多态性与鸡生长和体组成性状的相关分析。结果表明,除了rs14087994位点,其余位点的多态性与第两个群体的VLDL存在显著或极显著相关;rs16426347位点与14世代群体的睾丸重极显著相关;GGaluGA262866与14世代群体的1、3周龄体重以及心脏重显著相关;rs16425708与14世代群体的7周龄体重和屠体重显著相关。研究表明,五个位点所在的基因可能影响鸡脂肪沉积,与其他体组成性状相关的位点需进一步验证。; 金鹏程吴宪文王守志张慧李辉; 关键词：SNP

Lb-FABP和L-FABP与鸡生长和体组成性状的关联及其配基结合属性研究: 脂肪酸结合蛋白（FABPs）属于脂质结合蛋白的超家族成员，其分子量较小并对脂肪酸具有高度亲和力，对脂类代谢具有极为重要的调控作用。本研究对以东北农业大学肉鸡高、低腹脂双向选择品系和F2资源群体为实验材料，采用测序、飞行质...; 赵玉芳; 关键词：多态性

KDR等6个基因多态性与鸡生长和体组成性状的相关研究被引量：1: 2012年; 以东北农业大学高、低脂肉鸡双向选择品系第14世代群体(NEAUHLFG14)和AA肉鸡商业随机群体(AA群体)为试验材料,利用PCR-RFLP对鸡腹脂性状的全基因组关联分析(GWAS)鉴定出6个多态位点进行单核苷酸多态性(SNPs)检测,分析这些位点的多态性与鸡生长和体组成性状的关系。结果表明,在NEAUHLFG14中KDR基因的rs14483313位点多态性对腹脂重(AFW)和腹脂率(AFP)有显著影响(P<0.05),TUSC3基因的rs13548811位点对鸡后期体重有影响,EXOC1基因的GGaluGA263078位点在两个群体中都对7周龄体重(BW7)有显著影响(P<0.05)。TUSC3、PPAT、EXOC1和KIAA1211基因的突变位点对NEAUHLFG14极低密度脂蛋白(VLDL)浓度有显著影响(P<0.05),结果显示,6个基因可能是影响鸡腹脂性状的重要基因,但多态位点是否为功能性位点仍需进一步验证。; 吴宪文金鹏程王守志张慧李辉; 关键词：腹脂 SNPS KDR

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