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蕨麻猪产仔性状全基因组关联分析
2024年
本研究旨在挖掘影响蕨麻猪总产仔数(Total number born,TNB)和产活仔数(Number born alive,NBA)的候选基因,为蕨麻猪高繁殖力基因组选育提供参考数据。采集140头蕨麻猪耳组织样品,提取DNA,利用50K液相芯片进行SNPs检测。分别采用广义线性模型和混合线性模型对140头蕨麻猪个体的SNPs与TNB和NBA进行全基因组关联分析(Genome-wide association studies,GWAS),筛选影响该群体繁殖性状的候选基因。结果显示:针对TNB和NBA等2个性状,广义线性模型分别检测到14个和1个显著的SNPs位点。混合线性模型检测到TNB有2个显著的SNPs位点;未检测到显著影响NBA的SNP。筛选ZCCHC24、ENSSSCG00000046125和TENM1作为影响TNB的重要候选基因,ZCCHC24作为影响NBA的重要候选基因。
张丰霞杨德威崔茂盛李千军闫峻旦智草
关键词:蕨麻猪总产仔数产活仔数全基因组关联分析
一种基于机器学习的猪产仔性状的基因组表型值预测方法
本发明公开了一种基于机器学习的猪产仔性状的基因组表型值预测方法,属于地方种猪生产性状预测领域,该方法包括确定地方猪种,收集母猪的繁殖性状,得到原始表型数据集;校正原始表型数据集,并去除异常表型,得到目标表型数据集;提取目...
吴平先 王俊戈 刁淑琪 郭宗义 鲜凌瑾 陈力 白小青 柴捷 龙熙 邱进杰 王金勇
一种猪SNP位点、引物、试剂盒在猪产仔性状筛选中的应用
本发明涉及生物育种技术领域,具体涉及一种猪SNP位点、引物、试剂盒在猪产仔性状筛选中的应用。本发明首次挖掘得到能够影响蕨麻猪产仔性状的重要分子标记Ssc.X:101892220C>T,通过对Ssc.X:101892...
旦智草闫峻袁淑芳张丰霞才让东智丁兴文刘正群李宁梁世岳郑梓安主草曼
不同采精月龄、季节和品种对法系公猪精液性状产仔性状的影响
2024年
非洲猪瘟在中国的全面流行进一步加快了生猪养殖的规模化、集约化和立体化进程;同时,猪人工授精技术在国内得以广泛推广并在遗传改良、疾病控制和节省劳动力方面具备显著优势,高品质的公猪精液是人工授精成功的必要条件。公猪精液品质常规评估指标有采精量、密度、活力、精子数等,精子活力被认为是最重要的精液品质特征之一。公猪精液性状主要受品种、睾丸大小、月龄、营养、饲养环境、季节和采精月龄等因素影响。
邝伟键李玉林袁坤何艺平梁祥解
关键词:公猪精液精液品质采精精子数
母猪产仔性状相关基因MMP-2的分子标记及其应用
本发明公开了一种母猪产仔性状相关基因MMP‑2的分子标记及其应用,所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示;且该核苷酸序列中含有1个SNP位点,该SNP位点位于该核苷酸序列303bp处,其的碱基为C/T。所述...
徐德全孙晓彬刘敏李新宇黄顺涛罗淦
一种苏紫猪产仔性状相关全基因组SNPs筛选方法
本发明提供一种苏紫猪产仔性状相关全基因组SNPs筛选方法,组织样采集后提取DNA,DNA质控检测合格后,进行Illumina全基因组猪50K SNPs芯片检测,质控后得到有效数据用于后期的变异检测;然后进行全基因组关联分...
付言峰程金花廖超李辉赵为民涂枫戴超辉王学敏李碧侠
与猪产仔性状相关的SNP分子标记、鉴定及其组合应用
本发明公开了一种DHRS4基因中与猪产仔性状相关的SNP位点,所述SNP位点位于猪参考基因组Sscrofa11.1的Chr7:75253401(rs326982309)和参考基因组Sscrofa11.1的Chr7:752...
周荣刘颖李奎
文献传递
猪3号染色体上与产仔性状和窝内仔猪初生重整齐度显著关联的标记鉴定被引量:1
2020年
试验旨在寻找与猪产仔性状和窝内仔猪初生重整齐度显著关联的分子标记,为猪繁殖性状的遗传改良提供依据。在课题组前期进行的猪全基因组清扫分析的基础上,选定猪3号染色体上的2个SNPs位点(rs338309012和rs335824784),利用目标序列捕获测序分型技术,在丹系大白猪和美系大白猪群中对这2个SNPs位点与猪产仔性状(包括总产仔数、产活仔数、死胎及木乃伊胎数等)及窝内仔猪初生重整齐度进行关联分析。结果显示,rs338309012位点与总产仔数、木乃伊胎数显著关联(P<0.05),AC基因型母猪的总产仔数、木乃伊胎数均显著高于CC基因型(P<0.05);rs335824784位点与有效活仔数、木乃伊胎数显著关联(P<0.05),与产活仔数和死胎数极显著关联(P<0.01),不同基因型对产活仔数和有效活仔数的影响为GG>CG>CC,与之相反,对窝内仔猪初生重的变异系数、死胎及木乃伊胎数的影响为GG产仔性状和窝内仔猪初生重整齐度的分子标记。
王围围肖玉净马云龙刘向东李新云余梅
关键词:繁殖性状SNP
三个品系大白猪的ESR、FSHβ和PRLR基因多态性及其与产仔性状的关联分析
本研究以美系、丹系和加系三个品系的大白猪为实验对象:(1)共测定201头三个品系大白猪个体的线粒体D-loop区核苷酸序列,结合从NCBI下载的227个来自中国、韩国、日本、俄罗斯以及印度尼西亚的野猪个体信息,分析三个品...
谢晶晶
关键词:大白猪ESRFSHΒPRLR产仔性状
文献传递
大白猪FUT1和PRLR基因多态性与产仔性状的关联分析被引量:2
2019年
为探讨FUT1和PRLR基因多态性与母猪繁殖性状的相关性,该试验采取PCR-RFLP和PCR检测方法对909头大白猪群体进行FUT1和PRLR基因的多态性检测,并对不同基因型的总产仔数、产活仔数、健仔数、窝重等与繁殖相关的性状进行了关联性分析。分析结果显示,在该试验群体中B基因是FUT1的优势等位基因,A基因是PRLR的优势等位基因。对于FUT1基因,AA型个体死胎比BB型少0.31头/胎(P <0.05),AA型个体总活仔数比AB型个体高1.30头/胎(P <0.05),其他繁殖性状上各基因型间均无显著差异。对于PRLR基因,AA型个体窝重比BB型个体显著高出0.84头/胎(P <0.05),各基因型间其他繁殖性状上均无显著差异。合并基因型分析发现:在大白猪中PRLR-FUT1最优分子标记组合为BBAA,其次是ABAA型组合较佳。
谢苏孙晓梅孙义姗黄涛
关键词:大白母猪PRLR繁殖性状基因多态性

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孟庆利
作品数:98被引量:387H指数:10
供职机构:北京养猪育种中心
研究主题:种猪 种公猪 繁殖性能 育种中心 产活仔数
李娜
作品数:184被引量:318H指数:9
供职机构:山西农业大学
研究主题:铅 花生 莲草直胸跳甲 星豹蛛 财务管理
刘铁铮
作品数:142被引量:565H指数:13
供职机构:江苏省农业科学院
研究主题:苏钟猪 饲料添加剂 鸡蛋 冷冻保存 莫能菌素
曹果清
作品数:223被引量:666H指数:11
供职机构:山西农业大学
研究主题:多态性 基因 山西白猪 白猪 大白猪
王立贤
作品数:303被引量:946H指数:17
供职机构:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
研究主题:育种 种猪 引物 性状 大白猪