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一种用于准确蛋白质二级结构预测的多任务学习框架
本发明属于生物信息技术领域，特别涉及一种用于准确蛋白质二级结构预测的多任务学习框架。本发明设计强针对性自编码器(HTA)作为驱动，对序列进行与同源蛋白无关的编码，以提升蛋白质二级结构的三态和八态预测性能。在HTA生成的强...
王珣宋弢冯润秋
基于深度学习的核糖核酸二级结构预测方法
2025年
本文提出了一种基于深度学习的方法 UCEfold,用于预测核糖核酸(Ribonucleic acid,RNA)二级结构。UCEfold是一种同时采用“序列”和“图像”作为深度学习模型输入提取隐藏特征的全新方法,并在模型中加入一定的先验知识提高预测精度。在RNAStralign和ArchiveⅡ两个数据集上测试UCEfold模型,结果表明UCEfold性能显著优于传统方法,能够更准确地预测带假结的RNA序列,并具有较强的泛化能力,有效解决了传统算法复杂度高、效率低下且无法预测假结的瓶颈。
刘元宁臧子楠张浩张浩
关键词：计算机应用
一种多类不平衡蛋白质二级结构预测方法和系统
本发明公开了一种多类不平衡蛋白质二级结构预测方法和系统，涉及计算机辅助药物研发技术领域。包括获取待预测的目标蛋白质序列，将待预测的目标蛋白质序列输入预构建的基于Transformer的多类不平衡蛋白质二级结构预测模型，获...
何朝政 赵君研 肖秦琨 付玲
基于多任务深度学习的蛋白质二级结构预测方法
本发明提供一种基于多任务深度学习的蛋白质二级结构预测方法，包括如下步骤：1)数据预处理与特征编码2)构建用于蛋白质二级结构预测的多任务深度学习模型3)模型训练、验证与独立测试。本发明属于生物信息学领域，本发明提供的基于多...
王珣冯润秋
一种多类不平衡蛋白质二级结构预测方法和系统
本发明公开了一种多类不平衡蛋白质二级结构预测方法和系统，涉及计算机辅助药物研发技术领域。包括获取待预测的目标蛋白质序列，将待预测的目标蛋白质序列输入预构建的基于Transformer的多类不平衡蛋白质二级结构预测模型，获...
何朝政 赵君研 肖秦琨 付玲
一种基于循环神经网络的蛋白质二级结构预测方法
一种基于循环神经网络的蛋白质二级结构预测方法，首先根据输入的待进行二级结构预测的蛋白质序列，使用独热编码方式对蛋白质序列进行编码，获取一个L×20的特征矩阵M<Sub>1</Sub>，使用PSI‑BLAST程序生成蛋白质...
胡俊殷文杰贾宁欣曾文武董明张贵军
一种基于单氨基酸序列特征的蛋白质二级结构预测方法
一种基于单氨基酸序列特征的蛋白质二级结构预测方法，它属于生物信息学领域。本发明解决了由于进化信息特征获取存在局限性且模型忽略了氨基酸序列中二级结构标签之间的相互依赖关系，导致利用现有方法获得的模型预测效果不佳的问题。本发...
董本志 苏慧
一种蛋白质二级结构预测方法、装置及计算机装置
本发明涉及蛋白质二级结构预测领域，具体涉及一种蛋白质二级结构预测方法、装置及计算机装置，提高了蛋白质二级结构预测的精确性。方案包括：通过预训练蛋白质语言模型获得给定蛋白质的序列嵌入特征；通过位置特定评分矩阵的计算方式得到...
许龙倩刘勇国李巧勤朱嘉静张云
基于深度学习的蛋白质二级结构预测研究
蛋白质二级结构作为生命科学领域的重要组成部分，揭示了蛋白质的局部构象，指导和确认了蛋白质的功能，为改造现有蛋白质和进一步设计新型药物分子提供了可靠依据。在深度学习算法的不断发展和输入进化信息的丰富下，利用计算的方法构建氨...
赵君研
关键词：蛋白质二级结构预测
一种知识与数据融合的RNA二级结构预测方法
RNA（Ribonucleic Acid）作为承载遗传信息的载体，在基因表达和蛋白质合成等生物学过程中扮演重要角色，不同类型的RNA由于其特定结构能够实现不同功能。不过 RNA 三级结构更为复杂且易受温度影响，结构相对不...
杨恩斌
关键词：RNA二级结构预测知识提取数据融合
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刘毅慧
作品数：49被引量：78H指数：5
供职机构：齐鲁工业大学
研究主题：蛋白质二级结构预测 蛋白质 支持向量机 HBV再激活 特征提取
刘元宁
作品数：144被引量：224H指数：7
供职机构：吉林大学
研究主题：虹膜 虹膜识别 计算机应用 RNA二级结构 虹膜特征
张浩
作品数：191被引量：217H指数：8
供职机构：吉林大学
研究主题：生物信息学 计算机应用 RNA二级结构 解剖学 二级结构预测
张波
作品数：21被引量：6H指数：1
供职机构：南通大学
研究主题：M29 周期型马来丝虫 马来丝虫 蛋白疫苗 重组蛋白表达
吴佳倩
作品数：15被引量：1H指数：1
供职机构：南通大学
研究主题：M29 周期型马来丝虫 马来丝虫 蛋白疫苗 重组蛋白表达