公共文化服务平台

搜索到1266篇“ 三维定量构效关系“的相关文章

分子特征的提取及三维定量构效关系的计算方法及装置: 本发明公开了一种分子特征的提取及三维定量构效关系的计算方法及装置，其中，该提取方法包括：获取分子的第一特征矩阵；根据所述第一特征矩阵及预设图卷积神经网络模型，生成分子第二特征矩阵；根据预设正方体像素模型及第二特征矩阵，生...; 贾伯阳

喹唑啉类FGFR4抑制剂的三维定量构效关系研究: 2024年; 目的:成纤维细胞生长因子19(fibroblast growth factor 19,FGF19)与成纤维细胞生长因子受体4(fibroblast growth factor receptor 4,FGFR4)信号通路的异常激活促进了肝细胞癌的增殖,FGFR4成为了治疗肝细胞癌的重要靶点之一。该文旨在采用三维定量构效关系的方法阐明喹唑啉类FGFR4抑制剂结构与活性的关系。方法:将36个化合物通过随机抽取的方法分为训练集和测试集,基于比较分子场分析法(comparative molecular field analysis,CoMFA)和比较分子相似指数分析法(comparative molecular similarity indices analysis,CoMSIA)构建三维定量构效关系模型。结果:所建立的CoMFA和CoMSIA模型的交叉验证系数(q^(2))分别为0.735、0.680,拟合验证系数(r^(2))分别为0.974、0.981,两个模型预测值与实验值基本一致,说明模型具有预测能力和良好的稳健性。结论:等势图描绘了不同场效应对化合物活性的影响,为新型喹唑啉类FGFR4抑制剂的设计提供了思路。; 路晨轩陈茁茁李国峰刘星媛孟宏覃语涵李亚鑫; 关键词：三维定量构效关系 COMFA COMSIA

新型长叶烯基萘满并N-酰基吡唑化合物的合成、抗增殖活性、三维定量构效关系及分子对接研究: 2024年; 为了探寻新型的抗癌药,以可再生的天然产物长叶烯为原料,设计并合成了21个新型长叶烯基萘满并N-酰基吡唑化合物,利用FT-IR,1H NMR,13C NMR,HRMS和X射线单晶衍射等方法对目标化合物的结构作了表征.采用噻唑蓝(MTT)法测定目标化合物的体外抗增殖活性.结果表明,部分化合物的抗增殖活性优于阳性对照5-氟尿嘧啶(5-FU).其中,长叶烯基萘满并N-对氰基苯甲酰基吡唑(6r)(R=p-CNC6H4)对人乳腺癌(MCF-7)细胞株的IC50为4.97μmol/L,长叶烯基萘满并N-对硝基苯甲酰基吡唑(6q)(R=p-NO2C6H4)对人结肠癌(SW480)细胞株的IC50为8.02μmol/L,均表现出显著的抗增殖活性.化合物6q(R=p-NO2C6H4)对MCF-7细胞株、人胃癌(MGC-803)细胞株、人肝癌(HePG2)细胞株、人宫颈癌(Hela)细胞株和人肺癌(A549)细胞株的IC50值分别为10.97,11.95,19.78,20.15和23.45μmol/L,表现出良好的广谱抗增殖活性.此外,利用构建的三维定量构效关系(3D-QSAR)模型(r^(2)=0.986,q^(2)=0.631)研究目标化合物分子结构与抗增殖活性之间的关系,并通过分子对接模拟目标化合物与Survivin蛋白的相互作用模式.; 秦丽清林桂汕段文贵段文贵杨卯芳李芳耀李典鹏; 关键词：抗增殖活性分子对接

PD-1/PD-L1抑制剂的三维定量构效关系和分子对接研究被引量：2: 2023年; 目的探讨程序性死亡受体-1(PD-1)、程序性死亡受体配体-1(PD-L1)抑制剂的三维定量构效关系和分子对接研究。方法针对现有的小分子化合物进行合理研究,取45个新型o-(联苯-3-基甲/氧基)硝基苯抑制剂进行三维定量构效关系研究,包括使用分子力场分析法(comparative molecular field analysis,CoMFA)和比较分子相似性指数法(comparative molecular similarity indices analysis,CoMSIA),并且对分子对接,观察小分子与5J89蛋白的结合效果。结果Co MFA模型(q^(2)=0.644,r^(2)=0.950)和CoMSIA模型(q^(2)=0.622,r^(2)=0.998)具有一定预测能力。TYR:56、GLN:66氨基酸是影响这些抑制剂活性的主要氨基酸。结论该研究是计算机辅助药物方法在抗肿瘤方面的应用,可为开发PD-1/PD-L1抑制剂作为抗癌药物提供参考。; 张璐赵学敏张清昱戴晨余秀燕黄奎龙沈燕林治华; 关键词：程序性死亡受体-1 抑制剂三维定量构效关系

2-取代苯基-5-取代苯甲酰胺基-1,3,4-噻二唑的合成、抑菌活性及三维定量构效关系被引量：2: 2022年; 以取代苯甲酸为起始原料,与氨基硫脲、三氯氧磷及取代苯甲酰氯进行缩合,制备了33个2-取代苯基-5-取代苯甲酰胺基-1,3,4-噻二唑E_(1)~E_(33)。采用核磁共振氢谱(^(1)H NMR)和高分辨质谱(HRMS)等对目标化合物的结构进行了确证及表征。采用菌丝生长速率法测定了目标化合物对根霉Rhizopus nigricans、青霉Penicillium glaucum、灰霉Botrytis cinerea、交链孢霉Alternaria brassicae和黑曲霉Aspergillus niger的体外抑菌活性。针对黑曲霉的抑制活性,分别利用CoMFA和CoMSIA对目标化合物进行了初步的三维定量构效关系(3D-QSAR)研究。结果表明,大部分化合物表现出良好的抑菌活性,在50μg/mL下,化合物E_(1)、E_(2)和E_(29)对供试真菌的抑制率均达到80%以上,与对照药剂百菌清和多菌灵的抑菌效果相当。综合两种模型的结果,发现静电场的贡献值高于其他势场,且当苯环a的4位引入供电子基、苯环a的2位和6位以及苯环b上引入吸电子基时,有利于化合物抑菌活性的提高,可为进一步指导设计合成此类高活性化合物提供理论依据。; 王三艳彭雅琦娄佳玉王美怡; 关键词：1,3,4-噻二唑酰胺衍生物抑菌活性

含天然蒎烯结构的4-酰基-3-氨基-1,2,4-三唑-硫醚衍生物的合成、抑菌活性、三维定量构效关系及分子对接研究被引量：1: 2022年; 为了探寻以天然可再生资源为基础的生物活性分子,设计并合成了24个新型含天然蒎烯结构的4-酰基-3-氨基-1,2,4-三唑-硫醚衍生物,通过IR,^(1)H NMR,^(13)C NMR,ESI-MS和元素分析对所有目标化合物的结构进行了表征.初步的离体抑菌活性测试结果表明,在质量浓度为50μg/mL时,目标化合物对测试的8种植物病原菌表现出一定的抑菌活性,其中有4个化合物对苹果轮纹病菌有优良的抑菌活性,远优于阳性对照百菌清;2个化合物对花生褐斑病菌有良好的抑制活性,远优于阳性对照百菌清.使用比较分子力场分析法(CoMFA)对目标化合物的抗苹果轮纹病菌活性进行了初步的三维定量构效关系(3D-QSAR)分析,建立了一个合理的3D-QSAR模型(r^(2)=0.961,q^(2)=0.613).此外,分子对接结果表明,目标化合物诺卜醇基4-(4'-氟苯甲酰基)-3-氨基-1,2,4-三唑-硫醚(5k)在琥珀酸脱氢酶(SDH)活性口袋的结合模式与商品杀菌剂萎锈灵相似.; 王秀段文贵林桂汕李宝谕张文静雷福厚; 关键词：Β-蒎烯诺卜醇抑菌活性

分子特征的提取及三维定量构效关系的计算方法及装置: 本发明公开了一种分子特征的提取及三维定量构效关系的计算方法及装置，其中，该提取方法包括：获取分子的第一特征矩阵；根据所述第一特征矩阵及预设图卷积神经网络模型，生成分子第二特征矩阵；根据预设正方体像素模型及第二特征矩阵，生...; 贾伯阳; 文献传递

2,6,9-三取代嘌呤衍生物三维定量构效关系和靶点相互作用被引量：1: 2021年; 采用易位体比较分子场(Topomer CoMFA)法研究2,6,9-三取代嘌呤类衍生物的三维定量构效(3D-QSAR)关系,将45个化合物随机分为训练集和测试集,以电性参数和立体参数为自变量,pIC 50为因变量,采用偏最小二乘法进行模型拟合,抽一法交互验证检验模型的内部预测能力,测试集验证模型的外部预测能力,所得优化模型的F检验值、拟合、交互验证及外部验证系数分别为100.35,0.954,0.929,0.566。通过Surflex-dock分子对接研究嘌呤类衍生物与CDK2的作用模式,3D-QSAR模型和分子对接结果表明,嘌呤6位宜引入较大体积,2位宜引入负电性取代基,9位宜取代长碳链基团。; 贾磊朱财盛麦曦冯丽华杜巧丽何玲何卫保张其民; 关键词：嘌呤三维定量构效关系靶点

咪唑[1,2-b]哒嗪类mTOR抑制剂的三维定量构效关系及分子对接研究: 2021年; 目的:建立咪唑[1,2-b]哒嗪类mTOR抑制剂的三维定量构效关系(3D-QSAR)和分子对接模型。结合两个模型实验结果,分析化合物的结构与其生物活性间关系。方法采用比较分子分析法(CoMFA)和比较分子相似性指数分析法(CoMSIA)来研究咪唑[1,2-b]哒嗪类mTOR抑制剂的三维定量构效关系,用分子对接方法来研究化合物与受体蛋白之间的相互作用模式。结果:建立了可靠、合理的咪唑[1,2-b]哒嗪类mTOR抑制剂CoMFA(q^(2)=0.628,r^(2)=0.989,r^(2)p red=0.991)和CoMSIA(q^(2)=0.593,r^(2)=0.988,r^(2) pred=0.989)模型。通过分析分子对接模型得出化合物与受体蛋白之间有关键的氢键连接。设计出了新化合物并预测了活性。结论:根据3D-QSAR模型得到咪唑[1,2-b]哒嗪类mTOR抑制剂的结构与生物活性之间的关系,分析分子对接模型发现化合物与受体蛋白之间的作用关系,基于以上设计出了具有较好活性的新化合物。实验的研究发现为该类mTOR抑制剂的设计优化提供了思路。; 王小平张静陈成龙毛蓓蓓; 关键词：MTOR抑制剂三维定量构效关系分子对接

靶向乙酰胆碱酯酶和几丁质合成酶杀虫剂衍生化合物三维定量构效关系模型构建: 2021年; 为获得活性更佳且同时具备苯甲酰基脲类和氨基甲酸酯类活性的新型双靶标杀虫剂——N-氯磺基-N-甲基氨基甲酸酯衍生物,构建此类化合物的三维定量构效关系(three-dimensional quantitative structure-activity relationship,3D-QSAR)模型,以18种具有双靶标活性的N-氯磺基-N-甲基氨基甲酸酯衍生物为训练集,分别采用比较分子力场分析(comparative molecular field analysis,CoMFA)法和比较分子相似性指数分析(comparative molecular similarity index analysis,CoMSIA)法进行3D-QSAR模型的构建,基于3D-QSAR模型分析同一骨架取代基的变化带给化合物的活性变化,预测不同力场对化合物活性的影响,并对设计的衍生化合物进行活性预测分析。结果表明,经CoMFA法和CoMSIA法构建的3D-QSAR模型可信度高(交叉验证系数q^(2)分别为0.728和0.563),且有良好的活性预测能力(非交叉验证系数r^(2)分别为0.954和0.981)。基于该模型得到的化合物预测活性与实际活性残差较小且存在良好的线性关系,进一步证明所得3D-QSAR模型的可靠性。通过分析3D-QSAR模型的力场分布,推测在R1基团处引入位阻较大的疏水性基团、在R2基团苯环的邻位引入同时具有负电性和疏水性但不含卤素原子的基团、用负电性的大位阻基团取代R基团等均可提高N-氯磺基-N-甲基氨基甲酸酯的活性。基于此设计的20种衍生化合物的活性变化从正反两方面印证了该推测的合理性。研究成果可用于指导兼具苯甲酰基脲类和氨基甲酸酯类杀虫剂作用机制的N-氯磺基-N-甲基氨基甲酸酯衍生物的设计。; 李睿驰刘吉元; 关键词：氨基甲酸酯类三维定量构效关系

加载更多 ∨

相关作者

用户反馈

相关作者

用户登录

用户反馈