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三维 全息 原子 场 作用 矢量 用于苦味二肽QSAR研究被引量:2 2017年 本文利用三维 全息 原子 场 作用 矢量 (3D-Ho VAIF)对苦味二肽分子结构进行表征,并利用逐步回归结合多元线性回归建立苦味二肽定量构效关系模型,同时采用内外部双重验证的方法检验模型的稳定性.所建模型相关统计参量如下:复相关系数(R_(cum)~2)、留一法(LOO)交互验证相关系数(R_(cv)~2)、外部样本验证相关系数(Q_(ext)~2)和均方根误差(RMSE)分别为0.983、0.934、0.876和0.145.结果表明,3D-VAIF能较好地表征苦味二肽结构,优于传统的氨基酸描述子.为强活性肽类药物分子设计和改造提供指导. 仝建波 李康楠 吴英纪 占培关键词:三维全息原子场作用矢量 多元线性回归 定量构效关系 三维 全息 原子 场 作用 矢量 用于均三氮苯类衍生物除草活性的QSAR研究被引量:1 2017年 本文利用三维 全息 原子 场 作用 矢量 (3D-HoVAIF)对均三氮苯类衍生物分子结构进行表征,并利用逐步回归结合多元线性回归建立均三氮苯类衍生物除草活性的定量构效关系模型,同时采用内外部双重验证的方法检验模型的稳定性.所建模型相关统计量如下:建模相关系数(R)、留一法(LOO)交互验证相关系数(R_(cv))、外部样本验证相关系数(Q_(ext))和标准偏差(SD)分别为0.897、0.818、0.856和0.470.结果表明,3D-HoVAIF能较好地表征均三氮苯类衍生物分子的结构信息,所建模型具有良好的稳定性和预测能力;同时也指出了SP^3杂化的C之间的立体作用 、SP^2杂化的N与SP^3杂化的C之间的立体作用 、SP^2杂化C与SP^3杂化的N原子 之间的静电作用 以及SP^3杂化的C与X(卤素)之间的静电作用 是影响该类化合物除草活性的重要因素.为高活性除草剂类分子设计和改造提供理论指导. 李美萍 张生万关键词:多元线性回归 定量构效关系 三维 全息 原子 场 作用 矢量 用于5′-甲硫腺苷核苷酶抑制剂的定量结构-活性相关研究被引量:2 2011年 采用三维 全息 原子 场 作用 矢量 (Three-dimensional Holographic Vector of Atomic Interaction Field,3D-HoVAIF)对33个5′-甲硫腺苷核苷酶抑制剂进行结构表征并与其抑制活性建立定量结构-活性相关(Quantitative Structure Activity Relationship,QSAR)模型。分别采用多元线性回归(MLR)和偏最小二乘回归(PLS)进行建模,同时采用内部及外部双重验证的方法对所建模型稳定性能进行分析和验证,建模计算值、留一法交互检验预测值和外部样本预测值的复相关系数R、Rcv、Qext分别为0.874,0.773,0.953(MLR);0.873,0.727,0.952(PLS)。表明三维 全息 原子 场 作用 矢量 能较好地表征该类分子的结构信息,所建QSAR模型具有良好的稳定性和预测能力;同时也指出了sp3杂化的C原子 与sp2杂化的N原子 ,以及sp3杂化的C原子 与sp3杂化的O/S原子 的静电作用 是影响5′-甲硫腺苷(MTA)类似物抑制5′-甲硫腺苷核苷酶(MTAN)活性的重要因素,有望对其它5′-甲硫腺苷核苷酶抑制剂的抑制活性预测及合成MTA类似物提供有效的理论依据。 李美萍 张生万关键词:三维全息原子场作用矢量 定量结构-活性相关 三维 全息 原子 场 作用 矢量 用于脂肪酸的QSRR研究被引量:2 2008年 采用三维 全息 原子 场 作用 矢量 (3D-HoVAIF)进行结构表征,研究脂肪酸定量结构保留指数关系(QS-RR),通过逐步回归(SMR)进行变量筛选,多元线性回归(MLR)建立定量构效关系模型。结果表明,所建模型的复相关系数r为0.998,留一法交互校验(LOO-CV)复相关系数rcv为0.983。3D-HoVAIF能较好地表征脂肪酸的结构信息,且所建模型具有较好的稳定性和预测能力。 景举华 张巧霞 李志良关键词:三维全息原子场作用矢量 脂肪酸 三维 全息 原子 场 作用 矢量 用于吡咯类抗艾滋病药物QSAR研究被引量:11 2008年 采用三维 全息 原子 场 作用 矢量 (3D-HoVAIF)对32个吡咯类抗艾滋病药物进行结构参数化表征,并与其活性建立定量构效关系。分别采用多元线性回归(MLR)和偏最小二乘(PLS)进行建模,建模的复相关系数(R2cum)、交互校验复相关系数(Q2cum)和模型的标准偏差(SD)分别为R2cum=0.914、Q2cum=0.812、SD=0.236(MLR);R2cum=0.836、Q2cum=0.719、SD=0.314(PLS),结果均优于文献值(R2cum=0.667,Q2cum=0.581,SD=0.420)。所建模型具有良好的稳定性和预测能力,表明3D-HoVAIF能够较好地表征该类分子的结构,值得进一步推广应用。 仝建波 刘淑玲 刘玉婷 李仲谨 韩玉英 王先锋关键词:三维全息原子场作用矢量 吡咯衍生物 抗艾滋病药物 定量构效关系 三维 全息 原子 场 作用 矢量 用于猫爪草脂肪酸的构效关系研究被引量:2 2008年 运用三维 全息 原子 场 作用 矢量 (3D-HoVAIF)对猫爪草中18种脂肪酸进行定量构效关系(QSAR)研究。采用逐步回归(stepwise multiple regression,SMR)进行变量筛选,偏最小二乘回归(partial least square regression,PLS)建立定量构效关系模型。所建模型复相关系数(R2cum)、留一法交互校验(CV)复相关系数(Qc2um)分别为0.977和0.946。结果表明,3D-HoVAIF能较好表征猫爪草中脂肪酸的结构信息,且所建模型具有较好稳定性和预测能力。 景举华 肖尚友 李志良关键词:三维全息原子场作用矢量 猫爪草 脂肪酸 定量构效关系 三维 全息 原子 场 作用 矢量 (3D-HoVAIF)用于神经氨酸酶抑制剂的结构表征与设计及定量构效关系(QSAR)研究被引量:6 2008年 对100个神经氨酸酶抑制剂抗禽流感药物结构并与其活性建立定量构效关系模型。采用本实验室提出的三维 全息 原子 场 作用 矢量 (3D-HoVAIF)对100个神经氨酸酶抑制剂进行结构表征,然后采用逐步回归对变量进行筛选后,运用偏最小二乘建立3D-HoVAIF描述子与神经氨酸酶抑制剂活性之间的QSAR模型。结果表明:复相关系数(R),交互校验的复相关系数(Q2)和模型的标准偏差(SD)分别为R2=0.805、Q2=0.657和SD=0.936,模型具有良好的稳定性和预测能力,并对文献中23个药物和设计的32个化合物进行了预测。表明三维 全息 原子 场 作用 矢量 能较好表征该类分子结构信息值得进一步推广应用。 朱万平 梁桂兆 廖立敏 杨娟 杨善彬 李志良关键词:神经氨酸酶抑制剂 定量构效关系 药物设计 三维 全息 原子 场 作用 矢量 用于嘌呤衍生物定量结构保留相关的研究被引量:9 2006年 采用本实验室新近提出的三维 全息 原子 场 作用 矢量 (3D—HoVAIF)对33个嘌呤衍生物进行定量结构保留相关(QSRR)的研究,运用逐步回归(SMR)筛选变量后,用偏最小二乘(PLS)回归建模与交互校验复相关系数,标准偏差分别为Rcum^2=0.966与Qcum^2=0.860及SD=0.112,均优于文献值,色谱保留预测模型具有良好的稳定性和预测能力.研究结果表明:3D—HoVAIF能较好地表征该类分子结构信息,有物化意义明确及结果易于解释等特点,值得进一步推广应用. 仝建波 周鹏 张生万 周原 梅虎 曾晖 李美萍 李志良关键词:三维全息原子场作用矢量 三维 全息 原子 场 作用 矢量 用于HEPT类抗艾滋病药物的QSAR研究被引量:11 2006年 采用本实验室新近提出的三维 全息 原子 场 作用 矢量 表征34个1-[(2-羟乙氧)甲基]-6-苯硫基胸腺嘧啶(HEPT)类抗艾滋病药物结构并与其活性建立定量构效关系模型.采用逐步回归对变量进行筛选后,运用多元线性回归(multiplelinearregression,MLR)建模的复相关系数(Rcu2m)、交互校验的复相关系数(Qcu2m)和模型的标准偏差(SD)分别为Rcu2m=0.928、Qcu2m=0.883与SD=0.43,均优于Hancsh报道的值(Rcu2m=0.911、Qcu2m=0.863与SD=0.45).模型具有良好的稳定性和预测能力,表明三维 全息 原子 场 作用 矢量 能较好表征该类分子结构信息,值得进一步推广应用. 仝建波 周鹏 张生万 梁桂兆 田菲菲 李美萍 李声时关键词:三维全息原子场作用矢量 定量构效关系 抗艾滋病药物 三维 全息 原子 场 作用 矢量 用于四氢-咪唑-苯二氮酮类抗艾滋病药物定量构效关系研究被引量:5 2006年 目的对23个四氢-咪唑-苯二氮酮(TIBO)类抗艾滋病药物分子进行定量构效关系(QSAR)研究。方法采用本实验室新近提出的三维 全息 原子 场 作用 矢量 (3D-HoVAIF)表征TIBO类抗艾滋病药物分子结构。然后运用偏最小二乘回归(partial least square regression,PLS)建立3D-HoVAIF描述符与TIBO类抗艾滋病药物活性之间的QSAR模型。结果用此方法建模的复相关系数(R2cum)、交互校验复相关系数(Q2cum)和模型的标准偏差(SD)分别为R2cum=0.824,Q2cum=0.778与SD=0.56,均优于文献值。结论3D-HoVAIF能较好表征TIBO类抗艾滋病药物分子结构信息,因而能建立具有良好稳定性和预测能力的QSAR模型。 仝建波 梁桂兆 周鹏 张生万 曾晖 李美萍 李志良关键词:三维全息原子场作用矢量 定量构效关系 抗艾滋病药物